元帥府為右昌的守護廟，建於永曆十五年(1661)，係民族英雄鄭成功抗清領台時紮營於此，號稱右營，因駐營將士都有崇神熱忱，故請軍師劉國軒蒞臨卜地，於右昌一巷現址立廟，而營中將士皆虔誠禮拜，鄰鄉遠里也爭來信仰，四境平安。元帥廟距今已有三百多年的歷史，是右昌地區最早建立的寺廟，也是居民的信仰中心，由於在信仰和祭拜儀式上頗具特色和傳奇性，深深影響了當地的民風和文化諸多層面。
右昌地方三百餘年來，奉祀元帥爺公為主神，居民平安、神靈顯化。元帥爺公每有旨意，則藉乩開口：革除以昔普渡中元之陋習；又拜神祇許上清香而禁焚紙錢；祭神祇許奉清茶、鮮果，而禁用三牲酒醴之葷味祭品等神教之特殊創舉。